1、公司決定設(shè)立分公司的，應(yīng)按期辦理登記手續(xù)，使其規(guī)范運作；決定不設(shè)立的，也應(yīng)盡快終止設(shè)立活動，撤銷相關(guān)文件，清退相關(guān)人員，決不能拖泥帶水。因為在分公司設(shè)立過程中所產(chǎn)生的相關(guān)債權(quán)債務(wù)要由做為“發(fā)起人”的本公司來承擔(dān)責(zé)任。一般來說設(shè)立分公司的，應(yīng)當(dāng)自決定作出或有關(guān)部門批準(zhǔn)之日起30天內(nèi)向公司(企業(yè))登記機關(guān)申請登記。
2、分公司負責(zé)人的選聘。分公司負責(zé)人可以說是分公司的核心部分，其對分公司的整個經(jīng)營運作起到很關(guān)鍵的作用，其個人的行為往往就是代表分公司的行為。所以在確定人選時要非常謹慎。對不熟悉的人，在任命之前，一定要對其個人資信作一個全面的調(diào)查了解。特別在有掛靠、承包性質(zhì)的分公司中，對主動上門尋求合作者，更不能只聽其片面之詞，而應(yīng)對事對人都進行詳細調(diào)查，必要時也可要求其提供一定的擔(dān)保，明確雙方之間的權(quán)利義務(wù)，以防上當(dāng)受騙。
3、規(guī)范分公司會計財務(wù)制度。由分公司會計人員做帳，本公司財務(wù)部做匯總與財務(wù)分析。依照規(guī)定，本公司應(yīng)直接負責(zé)對分公司員工的招聘，所以，要用好人事權(quán)，對于像會計等關(guān)鍵的職員，應(yīng)由本公司統(tǒng)一指派或招聘、管理，使其能獨立于分公司負責(zé)人，以免在財務(wù)上發(fā)生問題，損及公司利益。像震撼股市的鄭百文公司倒閉事件，倒閉的原因之一即為分公司的財務(wù)制度不健全，呈現(xiàn)在帳面上的逾期帳款如同天文數(shù)字一般。
4、明確本公司對分公司的指揮流程與分公司向本公司的報告流程。雖說分公司是在本公司之外的區(qū)域相對獨立的經(jīng)營，但其作為本公司經(jīng)營的一種延伸，其民事責(zé)任仍由本公司承擔(dān)，所以雙方不應(yīng)各自為政，而應(yīng)建立密切的聯(lián)絡(luò)機制，使本公司能對分公司進行有效的操縱，例如可規(guī)定對分公司大筆額的借貸等資金流動，明確應(yīng)由本公司批復(fù)認可，否則由相應(yīng)的人員承擔(dān)不利后果。
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